Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slfn5Q8CBA2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn5Q8CBA2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms