Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A430089I19RikQ8C9W1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A430089I19RikQ8C9W1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms