Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrbnQ8C7D2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CrbnQ8C7D2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrbnQ8C7D2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms