Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csgalnact2Q8C1F4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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