Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp38Q8BW70 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp38Q8BW70 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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