Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx17Q8BVL3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx17Q8BVL3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx17Q8BVL3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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