Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smad3Q8BUN5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad3Q8BUN5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad3Q8BUN5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad3Q8BUN5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms