Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Scfd2Q8BTY8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scfd2Q8BTY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scfd2Q8BTY8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms