Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
5730596B20RikQ8BQ08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms