Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga3Q8BMI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga3Q8BMI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga3Q8BMI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms