Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo38Q8BMI0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo38Q8BMI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms