Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tspan12Q8BKT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan12Q8BKT6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tspan12Q8BKT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms