Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prune1Q8BIW1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prune1Q8BIW1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prune1Q8BIW1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms