Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIV3

Ranbp6, Ran-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp6Q8BIV3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ranbp6Q8BIV3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ranbp6Q8BIV3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ranbp6Q8BIV3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ranbp6Q8BIV3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ranbp6Q8BIV3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms