Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdca8Q8BHX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdca8Q8BHX3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdca8Q8BHX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms