Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4933402J07RikQ8BHX0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4933402J07RikQ8BHX0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4933402J07RikQ8BHX0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms