Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe23Q8BGW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms