Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trmt12Q8BG71 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trmt12Q8BG71 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms