Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Necab1Q8BG18 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Necab1Q8BG18 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Necab1Q8BG18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms