Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atg4cQ811C2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg4cQ811C2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4cQ811C2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms