Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc1Q80VQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc1Q80VQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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