Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab3gap1Q80UJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab3gap1Q80UJ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab3gap1Q80UJ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms