Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RubcnQ80U62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RubcnQ80U62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
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