Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
NischQ80TM9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC44.93■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
NischQ80TM9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
NischQ80TM9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
NischQ80TM9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC44.71■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
NischQ80TM9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
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