Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mcph1Q7TT79 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcph1Q7TT79 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcph1Q7TT79 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms