Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyfip1Q7TMB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyfip1Q7TMB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyfip1Q7TMB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms