Protein–RNA interactions for Protein: Q7M757

C6.1al, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36-like, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6.1alQ7M757 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6.1alQ7M757 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6.1alQ7M757 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6.1alQ7M757 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6.1alQ7M757 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6.1alQ7M757 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms