Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smim12Q78RX3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim12Q78RX3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim12Q78RX3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms