Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h4Q6ZPZ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms