Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic3Q6X1Y6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic3Q6X1Y6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asic3Q6X1Y6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic3Q6X1Y6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Asic3Q6X1Y6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic3Q6X1Y6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic3Q6X1Y6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic3Q6X1Y6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic3Q6X1Y6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic3Q6X1Y6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic3Q6X1Y6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms