Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AY358078Q6UY53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms