Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf3Q6QR59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Tcaf3Q6QR59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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Tcaf3Q6QR59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Tcaf3Q6QR59 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Tcaf3Q6QR59 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
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Tcaf3Q6QR59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf3Q6QR59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf3Q6QR59 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms