Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna2d2Q6PHS9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna2d2Q6PHS9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna2d2Q6PHS9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms