Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dclk2Q6PGN3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dclk2Q6PGN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk2Q6PGN3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk2Q6PGN3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms