Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc85bQ6PDY0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms