Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd13aQ6PDE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd13aQ6PDE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms