Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtss1lQ6P9S0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtss1lQ6P9S0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtss1lQ6P9S0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms