Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcf1Q6P542 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcf1Q6P542 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms