Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Podnl1Q6P3Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Podnl1Q6P3Y9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms