Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrimpolQ6P1E7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrimpolQ6P1E7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrimpolQ6P1E7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms