Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Slx4Q6P1D7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Slx4Q6P1D7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Slx4Q6P1D7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Slx4Q6P1D7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Slx4Q6P1D7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms