Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrig3Q6P1C6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig3Q6P1C6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig3Q6P1C6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms