Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac4Q6NZM9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac4Q6NZM9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms