Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Soga3Q6NZL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Soga3Q6NZL0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Soga3Q6NZL0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga3Q6NZL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga3Q6NZL0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga3Q6NZL0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga3Q6NZL0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Soga3Q6NZL0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Soga3Q6NZL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms