Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt40Q6IFX3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt40Q6IFX3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt40Q6IFX3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt40Q6IFX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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