Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Smarca2Q6DIC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smarca2Q6DIC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Smarca2Q6DIC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Smarca2Q6DIC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms