Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cep170Q6A065 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cep170Q6A065 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cep170Q6A065 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cep170Q6A065 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cep170Q6A065 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms