Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprdQ64487 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprdQ64487 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprdQ64487 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprdQ64487 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprdQ64487 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprdQ64487 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprdQ64487 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprdQ64487 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprdQ64487 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprdQ64487 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprdQ64487 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprdQ64487 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprdQ64487 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprdQ64487 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprdQ64487 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprdQ64487 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprdQ64487 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprdQ64487 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprdQ64487 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprdQ64487 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprdQ64487 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprdQ64487 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprdQ64487 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprdQ64487 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PtprdQ64487 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprdQ64487 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PtprdQ64487 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PtprdQ64487 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtprdQ64487 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprdQ64487 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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