Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Surf4Q64310 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms