Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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Lcn4Q62472 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Lcn4Q62472 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lcn4Q62472 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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